TRIF через белок (receptor-interacting protein) воздействует на белковый комплекс IKK, фосфорилирующий ингибитор 1кВ, который затем высвобождает связанный с ним ядерный фактор NF-kB, последний транслоцируется в ядро и активирует экспрессию цитокиновых генов. TRAF6 способен передавать сигнал от TRIF на киназу ТАК1, которая затем может фосфорилировать 1КК-комплекс, а также киназы р38 и INK, а те в свою очередь фосфорилируют Транскрипционные факторы ATF-2 и c-Iun, защскающие Экспрессию генов цитокинов. Таким образом, длинная дцРНК при проникновении в клетку млекопитающего активируст систему интерферонового ответа и приводит к неспецифическому подавлению экспрессии Генов, поэтому использовать длинные дцРНК в качестве индукторов РНК интерференции в клетках Млекопитающих, за исключением ооцитов и малодифференцированных клеток эмбриона на ранних этапах развития, не представляется возможным. Для специфического выключения экспрессии определенных Генов в клетках млекопитающих успешно используют не протяженные двуцепочечные РНК, а короткис синтетические ду плекеы, имитирующие фрагменты РНК, полужающиеся в результате фрагментации дцРНК Дайеером — siPHK.